在食品高溫殺菌工作過程中，殺菌的主要對象是肉毒芽孢螺旋桿菌，此種菌能產(chǎn)生對人體造成致命傷害的毒素，其屬耐熱性厭氧菌，在121℃環(huán)境中三分將鐘將失去生物活性，在100℃環(huán)境中6個(gè)小時(shí)左右失去生物活性。當(dāng)然，溫度越高，該病菌存活時(shí)間越短。經(jīng)科學(xué)檢測，在121℃時(shí)殺菌較為適宜，此時(shí)包裝物有很好的耐熱性，而且食品口感也較為良好。121℃殺菌時(shí)，食品中心F值達(dá)到4，食品中就不會檢測出肉毒芽孢螺旋桿菌，達(dá)到了商業(yè)無菌的要求。
1、手動(dòng)控制型：所有閥門和水泵均由手動(dòng)控制，包括加水、升溫、保溫、降溫等工序。
2、電氣半自動(dòng)控制型：壓力由電接點(diǎn)壓力表控制，溫度由傳感器（pt100）和進(jìn)口溫控儀控制（精度為±1℃），降溫過程由人工操作。
3、電腦半自動(dòng)控制型:采用PLC和文本顯示器將采集的壓力傳感器信號和溫度信號進(jìn)行處理，可以儲存殺菌工藝，控制精度高，溫控可達(dá)±0.3℃。
4、電腦全自動(dòng)控制型：全部過程都有PLC和觸摸屏控制，可以儲存殺菌工藝，操作工只需按啟動(dòng)按鈕即可，殺菌完畢后自動(dòng)報(bào)警，溫控精度可達(dá)±0.1℃。
殺菌鍋主要從控溫精度和熱分布均勻性上進(jìn)行選擇，若產(chǎn)品要求溫度很嚴(yán)格，尤其是出口產(chǎn)品，因?yàn)橐鬅岱植己芫鶆?，所以?yīng)盡量選擇電腦全自動(dòng)殺菌鍋。電腦半自動(dòng)殺菌鍋溫度控制、壓力控制與電腦全自動(dòng)相同，但是價(jià)格卻是電腦全自動(dòng)的1/3。一般要求可以選擇電氣半自動(dòng)殺菌鍋。手動(dòng)殺菌鍋殺菌難度高，控溫和控壓等都由人工完成，食品外觀很難掌握，漲罐（袋）和破碎率高。
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